分析中心从数据中心获取各种数据，经分析处理后，生成卫星轨道、卫星钟差、地球定向参数、测站坐标和速度、测站钟差、对流层和电离层等核心产品。分析中心形成的产品发送至产品综合与服务中心，并在数据中心进行存储。

目前，iGMAS已建成12个分析中心，各分析中心功能相同，可独立开展工作。

12个分析中心为： *  武汉大学 *  上海天文台 *  信息工程大学  *  北京空间信息中继传输技术研究中心  *  北京航天飞行控制中心 *  中国测绘科学研究院 *  中科院测地所  * 长安大学 *  西安卫星测控中心 *  中科院国家授时中心 *  中国矿业大学 *  西安测绘研究所。

武汉大学分析中心连续多年分析中心评比中获得第一名。